（通讯员 杨阳 贠琳红）日前，陕西省教育厅、陕西省学位委员会下发《关于做好2022年陕西省优秀博士学位论文评选工作的通知》（陕教位办〔2022〕2号）文件，经单位推荐、通讯评议、专家会议评审和厅务会审议等程序，新浦京集团350Vp高琳教授指导的博士生叶育森博士学位论文成功入选（陕西省共100篇，全校共8篇入选），该论文题目为《三维基因组拓扑结构识别及表观调控建模》。截止目前，高琳教授已指导5名博士研究生获陕西省优秀博士学位论文。
陕西省优秀博士学位论文评选工作是陕西省对高等学校博士生学位论文进行水平评价和博士生人才培养质量评价的一项重要举措，展示了全省范围内博士生学位论文的最高水平。根据《陕西省优秀博士学位论文评选办法》（陕教规范〔2018〕9号），评选工作每年进行一次，每次评选出的陕西省优秀博士学位论文一般不超过当年博士学位授予人数的3%。近五年，我院每年均有博士学位论文入选陕西省优秀博士学位论文，充分体现了学院研究生人才培养取得的成效和计算机科学与技术学科的实力。
近来年，学院持续加强研究生学位论文质量监督保障体系建设，出台了《加强研究生学位论文质量监控实施方案》和《答辩后研究生学位论文抽查评估实施方案》，进一步强化学位论文过程管理，不断提升研究生学位论文质量。今后学院将持续开展研究生学位教育综合改革，加强研究生教育闭环管理，严把“入口-过程-出口”关，优化学位授予相关的科研成果要求，鼓励研究生不断探索新兴前沿科技和基础理论研究，将论文成果转化为科技创新成果，深耕人才培养模式，全面提升学院整体研究生人才培养质量。
论文简介：
组学测序生物技术的飞速发展，使得我们可以从更加微观的角度对细胞内和细胞间的调控机制加以解析，这方面研究得到了生命科学领域的高度重视。不同层次的组学技术也对生物信息学研究提出了新的挑战。针对高维度、超稀疏、高噪音的三维基因组学数据，呈现出的生物结构复杂、模式定义缺失、模式发现困难、模式生物功能及致病机理解释困难等特点，导致了计算建模、复杂模式定义、复杂特征提取等核心难题。论文提出的细胞周期环形轨迹推断算法，精细刻画细胞周期过程的高阶染色质结构；提出了解析三维基因组多尺度拓扑结构域的高效算法，首次定义成对拓扑结构域和启动子锚定的结构域，首次全面解析全基因组反式结构；推广矩阵分解理论，构建张量模型，将多种类型的转录因子交互数据集成到贝叶斯CP分解网络范式中，实现全局转录因子交互的精准预测。
论文的研究成果发表于国际顶级期刊《Advanced Science》（IF=17.521）、《Nucleic Acids Research》（IF =19.161）等；入选“2019年度中国生物信息学十大算法与工具”；收到Springer出版社书籍《Methods in Molecular Biology》章节邀请；收到领域国际国内会议邀请，在“生物信息学与智能信息处理学术会议”（BIIP2019）、“中国计算机学会生物信息学会议”（CBC2020）、“第六届国际三维基因组学研讨会”等做大会报告。
个人简介：
叶育森，工学博士，副教授，硕士研究生导师，入选新浦京集团350Vp“华山学者菁英人才计划”（菁英副教授）。2019年12月毕业于新浦京集团350Vp计算机应用技术专业，师从高琳教授。主要的研究方向为生物信息学，三维基因组学，单细胞组学，图表示学习等。研究成果发表在 《Advanced Science》、《Nucleic Acids Research》、《Bioinformatics》、中国计算机学会通讯等。担任中国计算机学会（CCF）生物信息学专业委员会通信委员，中国运筹学会计算系统生物学分会青年理事，BIB、Bioinformatics、TCBB、FIG等期刊审稿人。主持国家自然科学基金青年项目、参与国家自然科学基金重点项目、面上项目等4项。曾获“ACM SIGBIO中国新星奖”并推荐参评“ACM中国新星奖”、“西电首届校长奖学金”。研究成果入选“2019年度中国生物信息学十大算法”、“新浦京集团350Vp优秀博士学位论文”等。
